同时我们这种逐级蛋白对接的策略能够更广泛地应用到研究其它蛋白质-蛋白质相互作用的体系。
[目的]研究鼻咽癌(nasopharyngeal carcinoma, NPC)与间变性淋巴瘤激酶(anaplastic lymphoma kinase, ALK)基因重排及ALK融合蛋白表达情况,探讨鼻咽癌与PLX-4720细胞系ALK基因重排的关系。 [方法]收集中国医学科学院肿瘤医院病理科2006年-2009年祖籍中国北方的鼻咽癌活检病例共99例。所有病例均为福尔马林固定、石蜡包埋组织。采用免疫组织化学(immunohistochemistry, IHC)染色方法,应用ALK (D5F3)单克隆这个抗体检测99例鼻咽癌ALK融合蛋白表达。采用荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization, FISH)方法检测99例鼻咽癌中肿瘤细胞ALK基因重排情况。 [结果]在99例鼻咽癌中,按≥15%肿瘤细胞核内出现分离信号作为诊断ALK基因重排为什么阳性的标准,FISH检测到1例发生ALK基因重排,阳性率1.0%(1/99),阴性98例；免疫组织化学示1例ALK蛋白表达阳性,阳性率1.0%(1/99),蛋白表达定位于细胞浆。FISH与免疫组织化学分析所得阳性病例为同一例,二者检测结果完全吻合。 [结论] ALK基因重排及其蛋白表达在鼻咽癌病例中阳性检出率很低。鼻咽癌与ALK基因重排的关系仍待明确。