故早期诊断和治疗是结直肠癌病人获得良好预后的关键所在。生物信息学是涉及多个领域的一门交叉学科,其核心内容之一就是研究基因表达调控的内在机制,揭示人类疾病的本质规律,为更快速、准确的诊断和有效的治疗疾病创造了条件。本研究旨在应用基于芯片数据的生物信息学分析筛选出结直肠癌组织及其配对的癌旁非癌组织间的差异表达基因,同时搜索结直肠癌基因(即PI3K抑制剂种子基因),继续通过构建蛋白质—蛋白质相互作用网络、重启型随机游走分析、富集分析和药物—基因相互作用等手段探索出可能与结直肠癌发生发展相关的关键作用基因并初步分析其功能。然后通过检测关键基因在结直肠癌组织和细胞系中的表达情况,及其对结直肠癌细胞增殖、细胞周期和细胞凋亡的影响,来验证生物信息学分析的结果,为进一http://www.selleckchem.cn/products/epacadostat-incb024360.html步研究关键基因在结直肠癌中的分子机制提供依据,为找到应用于结直肠癌诊断和治疗的新基因靶点带来了可能性。从基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)下载到包括17对结直肠癌组织及其配对的癌旁非癌组织的基因芯片数据系列GSE32323后,结合Bioconductor中的AFFY软CB-839分子量件包和Brain Array Lab提供的Affy芯片探针注释文件对表达谱芯片数据进行标准化预处理。然后,用R语言中的limma软件包对上述预处理过后的表达矩阵进行差异表达分析,以筛选出结直肠癌组织及其配对的癌旁非癌组织间的差异表达基因。同时,从在线人类孟德尔遗传(Online Mendelian Inheritance in Man,OMIM)数据库中搜索了结直肠癌基因,即种子基因。